Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COG3Q96JB2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
COG3Q96JB2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COG3Q96JB2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms