Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGSM3Q96HU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGSM3Q96HU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms