Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
L3HYPDHQ96EM0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms