Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL38Q96DV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms