Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB2Q96DC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB2Q96DC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 654.7 ms