Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RCN3Q96D15 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCN3Q96D15 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms