Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBGCP3Q96CW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms