Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SDCCAG3Q96C92 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SDCCAG3Q96C92 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms