Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUBP1Q96AE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUBP1Q96AE4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms