Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX21Q969T3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX21Q969T3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms