Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP2A3Q93084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A3Q93084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms