Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD50Q92878 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD50Q92878 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms