Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBLCP1Q8WVY7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBLCP1Q8WVY7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBLCP1Q8WVY7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms