Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC7Q8WUI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms