Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms