Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms