Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGBL3Q8NEM8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGBL3Q8NEM8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms