Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHBP1Q8NDI1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHBP1Q8NDI1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHBP1Q8NDI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHBP1Q8NDI1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EHBP1Q8NDI1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHBP1Q8NDI1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EHBP1Q8NDI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms