Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf20Q8ND61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf20Q8ND61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf20Q8ND61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms