Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPC24Q8NBT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPC24Q8NBT2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPC24Q8NBT2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms