Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG16L2Q8NAA4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms