Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPA2Q8N8Q9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPA2Q8N8Q9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms