Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PHTF2Q8N3S3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHTF2Q8N3S3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms