Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC49Q8IUZ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC49Q8IUZ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms