Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM69Q86WT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM69Q86WT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM69Q86WT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM69Q86WT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM69Q86WT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms