Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS2Q86VP3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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