Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PBRM1Q86U86 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PBRM1Q86U86 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PBRM1Q86U86 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms