Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF5Q86SE9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF5Q86SE9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms