Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP1Q7Z6B7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.3 ms