Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMC3Q7Z5M5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMC3Q7Z5M5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC3Q7Z5M5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms