Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP49Q70CQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP49Q70CQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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