Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIAA1549LQ6ZVL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIAA1549LQ6ZVL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms