Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX8Q6ZV50 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX8Q6ZV50 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX8Q6ZV50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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