Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC149Q6ZUS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC149Q6ZUS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms