Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms