Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCDC141Q6ZP82 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC141Q6ZP82 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC141Q6ZP82 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms