Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZRN4Q6ZMN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZRN4Q6ZMN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms