Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD1Q6UXZ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms