Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD1Q6UWL2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUSD1Q6UWL2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms