Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NXPE4Q6UWF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXPE4Q6UWF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms