Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC4Q6S5L8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHC4Q6S5L8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHC4Q6S5L8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms