Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZBED9Q6R2W3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms