Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LARP1Q6PKG0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LARP1Q6PKG0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms