Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO38Q6PIJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms