Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms