Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms