Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF544Q6NX49 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms