Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCTP1Q6DN14 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCTP1Q6DN14 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms