Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
INTS3Q68E01 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INTS3Q68E01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms