Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RNF123Q5XPI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF123Q5XPI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms